O mérito científico do periódico é o principal critério para sua indexação na LILACS. O conteúdo do periódico deve refletir coerentemente sua missão, escopo e visão de futuro, conforme estabelecidos na política editorial.

• Artigos originais de pesquisa (mínimo de 50% do total de artigos publicados). Os artigos podem ser inéditos ou preprints previamente publicados em repositórios;
• Observações clínicas originais, acompanhadas de análise e discussão;
• Análises de aspectos técnicos, metodológicos, processuais, epidemiológicos, filosóficos, éticos ou sociais, incluindo relatos de casos, reuniões clínicas com discussão, estatísticas epidemiológicas com análise e discussão, e descrição ou avaliação de métodos ou procedimentos relacionados à área de Ciências da Saúde.

Não serão considerados para indexação:

• Boletins de notícias ou publicações com foco organizacional ou informativo;
• Periódicos de caráter comercial;
• Periódicos dedicados exclusivamente à divulgação científica;
• Periódicos que publicam predominantemente artigos traduzidos ou previamente publicados em outros periódicos.

É importante que o conteúdo publicitário ou o patrocínio comercial não comprometa a objetividade do material publicado nem gere conflitos de interesse.

Para periódicos que publicam exclusivamente relatos de casos ou séries de casos, serão desconsiderados os critérios de originalidade. No entanto, serão avaliadas a relevância e pertinência dos casos relatados, que devem incluir descrições completas e detalhadas dos casos, acompanhadas de discussões substanciais sobre sua relevância para a prática clínica e a pesquisa.

A análise do mérito científico no processo de avaliação LILACS conta com o apoio de pareceristas ad hoc especializados na área temática do periódico.

a) Republicação de artigos

Não serão aceitos artigos republicados, exceto nos casos previstos pela recomendação do ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors – Acceptable Secondary Publication). Para a republicação, é necessário obter a aprovação do editor do periódico em que o artigo foi publicado originalmente, com a citação da fonte original em nota de rodapé. A republicação de artigos por outros motivos, no mesmo ou em outro idioma, pode ser justificável e benéfica, especialmente para ampliar o alcance de descobertas importantes, desde que respeite as condições estabelecidas pelo ICMJE.

As Instruções aos Autores devem especificar que o artigo não pode ser submetido simultaneamente a dois ou mais periódicos. 

A LILACS desencoraja a publicação de artigos multipartes e de resultados parciais de uma mesma pesquisa. Caso dois ou mais artigos da mesma equipe de pesquisa utilizem o mesmo conjunto de dados para análise, cada um deve apresentar conteúdo substancialmente diferente, incluindo objetivos, métodos analíticos, discussões e conclusões exclusivas. Deve-se citar publicações anteriores que utilizaram o mesmo conjunto de dados, para garantir transparência. Se os objetivos, a interpretação dos dados e as conclusões forem semelhantes entre artigos, apenas o primeiro artigo será considerado, exceto em caso de estudos subsequentes ao primeiro que explicitamente declarem que visam à reprodução e/ou retestagem de hipóteses para fins de aumento da confiabilidade da literatura em saúde.